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點(diǎn)擊化學(xué)(ClickChemistry)標(biāo)記細(xì)菌和DNA

更新時(shí)間:2021-09-15   點(diǎn)擊次數(shù):2560次

標(biāo)記大腸桿菌

微生物細(xì)胞表面表達(dá)的蛋白質(zhì)可用于各種應(yīng)用并對其進(jìn)行操作。它們已被證明在廣泛的領(lǐng)域非常有用,包括蛋白質(zhì)工程、抗體片段篩選、全細(xì)胞催化劑、生物修復(fù)吸附劑等 。然而,一個(gè)主要的限制是只有 20 種天然存在的氨基酸。如果可以擴(kuò)展表達(dá)的氨基酸組或用合成衍生物專門替換某些氨基酸,則可以進(jìn)一步操縱表面蛋白,潛在應(yīng)用的數(shù)量將呈指數(shù)增加。在這個(gè)方向上,一些研究小組已經(jīng)取得了顯著的成功。


利用 HDC 反應(yīng)的高可靠性,Link 和 Tirrell 將一種含疊氮化物的合成氨基酸摻入大腸桿菌的表面蛋白質(zhì)中 。他們選擇的氨基酸是疊氮高丙氨酸 (AHA)。之前已經(jīng)表明 AHA 可以替代蛋白質(zhì)中的甲硫氨酸殘基  并且大腸桿菌的外膜蛋白 C (OmpC) 包含三個(gè)這樣的殘基。還創(chuàng)建了每個(gè) OmpC 含有九個(gè)甲硫氨酸殘基的突變大腸桿菌用于比較。一旦 AHA 被納入 OmpC 中,使用生物素化炔試劑進(jìn)行點(diǎn)擊反應(yīng)。兩種細(xì)胞都被成功地生物素化,但只有突變的大腸桿菌會(huì)與大分子抗生物素蛋白結(jié)合,這可能是由于額外的甲硫氨酸殘基周圍的空間擁擠較少。


標(biāo)記 DNA

寡核苷酸代表了一類非常重要的生物分子。盡管過去由于缺乏知識(shí),它們一直被制藥界“回避",但它們最近發(fā)現(xiàn)了許多應(yīng)用,并被認(rèn)為是許多研究領(lǐng)域最重要的工具。它們已被用于基因治療、作為治療白血病等疾病的反義劑、作為分子探針  等。添加不同的官能團(tuán)進(jìn)一步增加了它們的多功能性,特別是當(dāng)人們認(rèn)為可以引入功能化時(shí)在 3' 端、5' 端或內(nèi)部位置。新添加的官能團(tuán)可以作為與各種生物分子進(jìn)行生物偶聯(lián)的手柄。然而,目前用于 DNA 生物偶聯(lián)的方法效率低下。該程序必須能夠耐受水性條件,產(chǎn)生高產(chǎn)率,并且由此產(chǎn)生的連接必須在生物條件下穩(wěn)定。這是點(diǎn)擊化學(xué)的理想情況。


利用 HDC 反應(yīng),Seo 等人。能夠?qū)晒鈭F(tuán)標(biāo)記到單鏈 DNA 的 5' 末端 。寡核苷酸經(jīng)過多次反應(yīng)修飾,在其 5' 端顯示末端炔烴,熒光團(tuán)包含疊氮基官能團(tuán)。獲得了 91% 的產(chǎn)物收率,但在反應(yīng)中沒有使用催化劑,導(dǎo)致 1,4-取代和 1,5-取代的 1,2,3-三唑產(chǎn)物的混合物。如果使用銅催化劑,則很可能僅產(chǎn)生 1,4-取代的三唑,并且反應(yīng)進(jìn)行得更快。西拉等人。將 DNA 標(biāo)記更進(jìn)一步,合成了核苷,每個(gè)核苷的芳香核堿基上都含有一個(gè)末端炔烴。修飾的脫氧腺苷 (dA)、脫氧鳥苷 (dG)、脫氧胞苷 (dC) 和脫氧胸苷 (dT) 均包括在內(nèi)。使用固相合成,隨后合成了幾種寡核苷酸,其中含有一種修飾的核苷、兩種或根本不含(作為對照)。寡核苷酸及其雙鏈體的特性不受修飾的核苷的顯著影響,與對照相比時(shí)相似的解鏈溫度證明了這一點(diǎn)。然后通過點(diǎn)擊化學(xué)將含有疊氮基官能團(tuán)的報(bào)告分子與修飾的堿基綴合。結(jié)合后,報(bào)告分子開始發(fā)出熒光,表明寡核苷酸已被成功標(biāo)記。如果商業(yè)化,Seela 的修飾核苷可以使寡核苷酸標(biāo)記變得微不足道。


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